Candidatus

Candidatus en clasificación científica es un término formal que se coloca antes del género y la especie de una bacteria que no puede mantenerse en una "Colección de Cultivo Bacteriológico". Un ejemplo podría ser "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae". El estatus de "Candidatus" puede usarse cuando una especie o género está bien caracterizada pero es incultivable.

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Historia

Para una publicación válida, la bacteria debe poderse aislar, cultivar, describir, y depositar en una "Colección de Cultivo Bacteriológico". Sin embatgo, algunas bacterias requieren condiciones especiales de cultivo y no pueden ser mantenidas en una "Colección de Cultivo Bacteriológico". Eso incluye a patógenos obligatoriamente intracelulares y endosimbióticos, simbiotes de insectos, poblaciones de océanos o de fango. En 1994, Murray y Schleifer publican una nota taxonómica donde recomendaban que la nueva categoría de un indefinido rank (Candidatus) fuera establecida por ciertos taxones putativos que podrían no ser descriptos con suficiente detalle para garantizar el establecimiento de un nuevo taxon. También se recomendaba que una "Lista de Candidatus" podría establecerse en el "International Journal of Systematic Bacteriology" (ahora "International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology).

La nota taxonómica proponiendo el establecimiento del estatus provisional de Candidatus para procariotes incompletamente descriptos fue publicado en enero de 1995 en la IJSB. De acuerdo a esta nota, la categoría Candidatus debería usarse para describir a las entidades procariotas que diponen de más de una secuencia de ADN está disponible pero que no cumple con todas las características requeridas para su descripción de acuerdo al Código Internacional de Nomenclatura de Bacterias. Además de la información genómica tales como secuencias, debe incluirse oda otra información, incluyendo desarrollos estructurales, metabólicos, reproductivos.

Las nuevas especies de bacterias cultivables deben depositarse en al menos dos colecciones de cultivos públicas accesibles en diferentes países (Euzéby and Tindall, 2004).

Uso

De acuerdo al "Comité Ad Hoc para reevaluar definiciones de especies en bacteriología", los microbiológos enfatizan en usar el concepto de "Candidatus" para organismos bien caracterizados pero aún incultivables.

Los nombres incluídos en la categoría Candidatus se escriben usualmente así: Candidatus (en itálicas), el/los nombre/s subsecuente/s en tipo Romano (con la inicial del género en mayúscula) y el nombre entero entre comillas. Por ejemplo, "Candidatus Phytoplasma", "Candidatus Phytoplasma allocasuarinae".

De acuerdo al "Grupo de Trabajo IRPCM Fitoplasma/Spiroplasma" la abreviación para Candidatus debería ser Ca..

Referencias

• MURRAY (R.G.E.), SCHLEIFER (K.H.). Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes. Int. J. Syst. Bacteriol., 1994, 44, 174-176.

• JUDICIAL COMMISSION OF THE INTERNATIONAL COMMITTEE ON SYSTEMATIC BACTERIOLOGY. Minutes of the meetings, 2 a 6 julio 1994, Prague, Czech Republic. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 195-196.

• MURRAY (R.G.E.), STACKEBRANDT (E.). Taxonomic Note: implementation of the provisional status Candidatus for incompletely described procaryotes. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, 45, 186-187.

• JUDICIAL COMMISSION OF THE INTERNATIONAL COMMITTEE ON SYSTEMATIC BACTERIOLOGY. VIIth International Congress of Microbiology and Applied Bacteriology. Minutes of the meetings, 17 a 22 agosto 1996, Jerusalem, Israel. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 240-241.

• INTERNATIONAL COMMITTEE ON SYSTEMATIC BACTERIOLOGY. VIIth International Congress of Microbiology and Applied Bacteriology. Minutes of the meetings, 17, 18, a 22 agosto 1996, Jerusalem, Israel. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47, 597-600.

• DE VOS (P.), TRÜPER (H.G.), TINDALL (B.J.). Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes Xth International (IUMS) Congress of Bacteriology and Applied Microbiology. Minutes of the meetings, 28, 29 a 31 julio y 1 agosto 2002, Paris, France. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2005, 55, 525-532.

• STACKEBRANDT (E.), FREDERIKSEN (W.), GARRITY (G.M.), GRIMONT (P.A.D.), KÄMPFER (P.), MAIDEN (M.C.J.), NESME (X.), ROSSELLO-MORA (R.), SWINGS (J.), TRÜPER (H.G.), VAUTERIN (L.), WARD (A.C.), WHITMAN (W.B.). Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, 52, 1043-1047.

• The IRPCM Phytoplasma/Spiroplasma Working Team - Phytoplasma taxonomy group. 'Candidatus Phytoplasma', a taxon for the wall-less, non-helical prokaryotes that colonize plant phloem and insects. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 1243-1255.

• INTERNATIONAL COMMITTEE ON SYSTEMATICS OF PROKARYOTES. REQUEST FOR AN OPINION:

EUZÉBY (J.P.), B. J. TINDALL (B.J.). Status of strains that contravene Rules 27(3) and 30 of the Bacteriological Code. Request for an Opinion. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, 54, 293-301.